ChIP-seq是最-广泛使用的染色质图谱检测方法，但有很大的局限性，具体表现为：
1.高细胞需求量；
2.低吞吐量；
3.技术困难；
4.高成本，深度测序；
5.数据质量差，变量大
CUT&RUN和CUT&Tag检测法正在取代ChIP-seq
简化的工作流程跳过了ChIP-seq实验法中的挑战性步骤，包括染色质片段化和抗体pull down，用更少的细胞和测序读数得到更佳的数据。
具体变现为：
1.低细胞需求量；
2.高吞吐量；
3.操作流程更简易；
4.低成本，测序读取次数更少；
5.数据质量可靠，重复性好
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